Kot was predikant in de Hersteld Hervormde Gemeente van Huizen toen er grote problemen ontstonden in die kerk. De kerk scheurde in tweeën, waarna een deel van de gemeente afzonderlijke bijeenkomsten ging beleggen. Dat deel werd niet officieel erkend door de Hersteld Hervormde Kerk en Kot mocht er dus ook niet voorgaan. Dat deed hij echter wel. Ook was hij pastoraal actief voor het afgescheiden gedeelte. De landelijke kerk legde hem daarom meermaals een tuchtmaatregel op en hij werd geschorst. 

Toch bleef Kot zich inzetten voor het afgescheiden gedeelte van de kerk omdat hij ze naar eigen zeggen niet aan hun lot kon overlaten. Het conflict tussen hem en de Hersteld Hervormde Kerk zorgde er uiteindelijk voor dat de kerk besloot om hem los te maken van de Hersteld Hervormde Gemeente in Huizen en hem uit zijn ambt te zetten. Kot vocht dat besluit vervolgens aan bij de burgerlijke rechter, maar ving ook daar bot. 

Het afgescheiden gedeelte van de HHK in Huizen ging daarna verder als Vrije Hervormde Gemeente. Sindsdien is Kot aan die gemeente verbonden. Nu sluit hij zich echter aan bij de Protestantse Kerk in Nederland. Hij deed begin dit jaar het verzoek aan de PKN om beroepbaar gesteld te worden binnen die kerk. Afgelopen week besloot het moderamen van de generale synode om Kot per direct beroepbaar te stellen. Als hij zich daadwerkelijk aan een PKN-gemeente verbindt, zal de predikant overigens wel lid moeten worden van die kerk. 

Verklaring ds. Kot
Op basis van bovenstaand nieuws, legde Cvandaag een aantal vragen aan de predikant voor. In een schriftelijke verklaring laat Kot het volgende weten: "In de loop van de afgelopen twintig jaar ben ik meer en meer tot de overtuiging gekomen dat een zuivere kerkelijke grondslag nog geen garantie is voor een zuivere prediking en een gezond geestelijk en kerkelijk leven, en omgekeerd. Wij moeten het meer verwachten van wat God doet door Zijn Woord en Geest en minder van menselijk herstelwerk. Achteraf gezien heb ik dus in 2004 de verkeerde keuze gemaakt en ik wil graag door deze stap van die weg terugkeren."

Kot liet verder weten dat de Vrije Hervormde Gemeente Huizen zich niet bij de PKN zal aansluiten en dat hij voornemens is om de gemeente te blijven dienen zolang zij nog bestaat of totdat hij een beroep ontvangt en deze aanneemt. De predikant wijst erop dat de gemeente kwetsbaar is en nabij opheffing.